【科技日报】八倍体草莓端粒到端粒基因组发布

20日，记者从中国农业科学院获悉，该院郑州果树研究所草莓种质改良团队联合深圳农业基因组研究所共同发布八倍体草莓端粒到端粒基因组，系统解析了八倍体草莓亚基因组结构和遗传分化，并解析了亚基因组的表观遗传进化机制。相关成果日前发表于国际期刊《园艺研究》。

红颜草莓是我国主栽品种之一，其品质优良、丰产性强、商品性好，但对炭疽病、白粉病等抗性差，严重制约草莓产业的健康发展。

论文通讯作者、中国农业科学院郑州果树研究所研究员周厚成介绍，栽培草莓是复杂的八倍体植物。该研究以红颜草莓为材料，从头组装八倍体草莓端粒到端粒基因组，鉴定出包含ABCD四个亚基因组共109320个基因。通过构建系统进化树，发现B、C和D亚基因组来源于同一祖先或祖先近缘种，C和D亚基因组最先被引入到八倍体基因组中，A亚基因组是最后的直接祖先供体。分析表明，A亚基因组CG、CHG和CHH甲基化水平最低。亚基因组A偏向表达基因高于其他亚基因组，且A偏向表达同源基因多为基因体甲基化。该研究为后续开展草莓基因功能挖掘、抗性分子育种和品质改良提供了理论和数据支撑。

红颜草莓T2T基因组和表观遗传

中国农业科学院郑州果树研究所助理研究员宋艳红和深圳农业基因组所博士后彭艳玲为论文共同第一作者，周厚成和中国农业科学院深圳农业基因组所研究员周永锋为共同通讯作者。

（中国农业科学院郑州果树研究所供图）

责任编辑： 李梦一