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【科技日报】首个半野生型甜瓜T2T基因组组装成功

来源：科技日报 作者：马爱平 通讯员 赵倩 2023-12-07 16:42:49 浏览量：

近日，中国农业科学院郑州果树研究所甜瓜遗传育种与栽培团队联合国内有关科研院校对半野生型甜瓜“821”进行了高质量T2T基因组组装，为揭示甜瓜抗性相关基因和品质改良提供了重要遗传资源。相关研究成果发表在英文学术期刊《园艺研究》上。

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甜瓜是一种重要的园艺经济作物，多样性丰富。长期的人工选育致其一些相关性状基因丢失，使栽培品种的遗传多样性显著少于野生种，在一定程度上限制了对甜瓜抗性基因及优质性状的发掘。

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半野生型甜瓜821表型、Hi-C图谱和基因组景观图。

该研究首先完成了甜瓜单倍型T2T基因组的组装，通过基因组比较发现，在11号染色体存在基因拷贝数的变异，其中2个自噬基因与新德里病毒抗性显著相关。此外，通过全基因组关联分析，发现1个与果实成熟相关的显著信号，并鉴定出候选基因CmABA2，其编码一个细胞质短链脱氢酶，参与脱落酸的生物合成。该研究提供了高质量的半野生甜瓜基因组，为甜瓜抗性基因的挖掘和品质改良提供了遗传资源。

（中国农业科学院郑州果树研究所供图）

责任编辑： 孙莹


 

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